Il pagamento dell'imposta relativa alle fatture elettroniche emesse in ciascun trimestre solare è effettuato entro il giorno 20 del primo mese successivo. Per facilitare l’adempimento da parte del contribuente, al termine di ogni trimestre l'Agenzia delle entrate rende noto l'ammontare dell'imposta dovuta sulla base dei dati presenti nelle fatture elettroniche inviate attraverso il Sistema di interscambio (Ministero dell'Economia e delle Finanze - Decreto 28 dicembre 2018).